Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PatjQ63ZW7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PatjQ63ZW7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms