Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Polr2kQ63871 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms