Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sall3Q62255 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sall3Q62255 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms