Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms