Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddx3xQ62167 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms