Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms