Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lama3Q61789 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Lama3Q61789 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama3Q61789 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama3Q61789 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama3Q61789 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama3Q61789 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama3Q61789 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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