Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AtrxQ61687 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms