Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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EsrrbQ61539 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EsrrbQ61539 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms