Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcd2Q61285 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms