Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms