Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rbbp4Q60972 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms