Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Neurod1Q60867 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms