Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot7Q60809 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot7Q60809 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms