Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Traf3Q60803 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf3Q60803 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms