Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf3Q60765 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms