Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcf4Q60722 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms