Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms