Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bbs12Q5SUD9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bbs12Q5SUD9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bbs12Q5SUD9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.7 ms