Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Trappc1Q5NCF2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Trappc1Q5NCF2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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