Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf3Q5HZG4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms