Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ecm2Q5FW85 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms