Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bdp1Q571C7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bdp1Q571C7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms