Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf608Q56A10 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Znf608Q56A10 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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