Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhox3aQ4TU90 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms