Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc3lQ4KL14 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms