Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Snx25Q3ZT31 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms