Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pydc3Q3V3Q4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms