Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2Q3V1H1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms