Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc110Q3V125 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms