Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms