Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc27Q3V036 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc27Q3V036 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms