Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms