Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cops9Q3U898 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms