Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms