Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud5Q3U2S4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms