Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms