Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hace1Q3U0D9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms