Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dcaf17Q3TUL7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms