Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdpd4Q3TT99 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms