Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ctdnep1Q3TP92 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdnep1Q3TP92 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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