Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms