Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim7Q3TJD7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms