Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colec11Q3SXB8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms