Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrna5Q2MKA5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms