Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shroom4Q1W617 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms