Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fgfbp3Q1HCM0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fgfbp3Q1HCM0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Fgfbp3Q1HCM0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fgfbp3Q1HCM0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms