Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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ptchd1Q14B62 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ptchd1Q14B62 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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