Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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