Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col19a1Q0VF58 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col19a1Q0VF58 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col19a1Q0VF58 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col19a1Q0VF58 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col19a1Q0VF58 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col19a1Q0VF58 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col19a1Q0VF58 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms